Chaque système de traitement biologique nécessite une certaine masse de microorganismes actifs pour inoculer l’installation au début de l’opération ou pour restaurer la population biologique après une perturbation du système.
Certains types de technologie, tels que les technologies anaérobies utilisant des boues granulaires, nécessitent des formes de biomasse spécialisées afin de fonctionner correctement. Ce matériel est souvent difficile à trouver du fait de la forte demande et peut retarder le démarrage ou le redémarrage.
Lorsqu’il n’est pas disponible localement, son transport depuis un lieu éloigné peut être très coûteux. Dans certains cas, de grandes quantités de biomasses sont nécessaires et les quantités suffisantes ne sont tout simplement pas disponibles dans les lieux spécifiques.